Bazı Pamuk Çeşitlerinin ISSR Markörleri İle Karakterizasyonu


Creative Commons License

SAHIN C. B., İşler N., Rustamova V.

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi, cilt.23, sa.1, ss.108-116, 2020 (ESCI) identifier

Özet

Bu çalışmada, kültürü yapılan 30 pamuk çeşidi (Gossypium hirsutumL.) arasındaki genetik ilişkinin ISSR yöntemi kullanılarakbelirlenmesi hedeflenmiştir. Otuz pamuk çeşidinde polimorfizminbelirlenmesi amacıyla 24 ISSR primeri 8 pamuk çeşidinde testedilmiştir. Primerlerin yalnızca 9 tanesi PCR ürünü oluşturmuş vesonraki çalışmalar bu primerlerle sürdürülmüştür. Seçilen 9 adetISSR primeri 30 adet pamuk çeşidinde toplam 41 bant oluştururkenbu bantlardan ortalama 22.3 tanesinin polimorfik olduğu saptanmış,primer başına polimorfik bant sayısı ortalama 2.5 olarakgerçekleşmiştir. Araştırmada kullanılan tüm primerler pamuktapolimorfik bant üretirken, polimorfizm oranı primerlere bağlı olarak%6 ile %89 arasında değişim göstermiştir. ISSR primerlerine ilişkinpolimorfik bilgi içeriği değerleri 0.19 ile 0.68 aralığında değişimgöstermiş ve ortalama 0.49 olmuştur. Çeşitler arası ortalama Jaccardbenzerlik katsayısı 0.77 olarak bulunurken, UPGMA kümelemeanaliz sonucu 30 pamuk çeşidi genetik yakınlık açısından 2 anakümeye ayrılmıştır.
This study was conducted to determine the genetic diversity in 30 cotton (Gossypium hirsutum L.) cultivars extensively cultivated in Turkey by using ISSR DNA molecular markers. To investigate the genetic diversity in 30 cotton varieties by ISSR molecular marker, 24 ISSR primers were screened in 8 varieties. Overall, 9 of 24 which produced a PCR product were selected according their polymorphism level. These ISSR primers totally produced 41 bands, and 22.3 were polymorphic. The percentage of polymorphic bands per primer was detected as 2.5. The rate of polymorphism depending on the primers ranged between 6% and 89%. Average polymorphism information content was 0.49, with minimum PIC 0.19 and maximum PIC 0.68. While the Jaccard similarity coefficient between the genotypes was detected as 0.77, 30, cotton varieties were grouped within two main clusters in respect to genetic similarity based on UPGMA analyses.