Farklı bitki dokularından izole edilen bakterilerin bazı bitki patojeni funguslara karşı in vitro antifungal etkinlikleri ve mekanizmalarının belirlenmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİTKİ KORUMA (YL) (TEZLİ), Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: NURSEL EMDİRME
Danışman: EMİNE MİNE SOYLU
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Bu çalışmada, farklı bölgelerde yetişen kök ve yumrusu tüketilen sağlıklı bitkilerinin farklı kısımlarından epifitik ve endofitik antagonist bakteriyel izolatlar izole edilmiştir. Bakteriyel izolatların tanılanması, Sclerotinia sclerotiorum, Botrytis cinerea ve Geotrichum candidum'un misel gelişiminin engellenmesine yönelik antagonistik etkileri ve bitki büyümesini teşvik edici (PGP) etki mekanizmaları ikili kültür testi kullanılarak in vitro koşullarda belirlenmiştir. Toplam 47 endofitik ve epifitik bakteri türü izolatı elde edilmiş, MALDI-TOF ile tanılanmış ve her bir fungal patojennin misel büyümesi üzerindeki baskılayıcı etkileri taranmıştır. İkili kültür petrilerinde belirgin engelleme bölgelerinin oluşması, bakteriyel izolatlar tarafından antagonizm benzeri mekanizmanın patojenlerle etkileşimde kullanılan ana mekanizma olduğunu göstermiştir. Bakterilerin üç fungal izolatı için gösterdiği antagonistik etkinlik sonuçlarına göre, endofitik bakteri izolatları, epifitik bakteri izolatlarına kıyasla daha yüksek antagonistik aktiviteler göstermiştir. Antagonistik etkisi bulunan Bacillus spp., Pseudomonas spp. ve Acinetobacter spp. ait izolatlarının büyük çoğunluğu test edildikleri patojenlerinin misel gelişiminin baskılanmasında etkili olmuştur. Bacillus subtilis, Bacillus mojavensis, Bacillus thuringiensis, Acinetobacter tandoii, Pseudomonas chloropsis, Pseudomonas brassicacearum ve Pseudomonas koreensis fungal etmenlerin misel gelişimini % 75'in üzerinde baskılamak suretiyle en etkili bakteriyel antagonist bakteri türleri olarak belirlenmiştir. Etkili bakteriyel izolatlar tarafından gösterilen antagonistik ve bitki büyümesini teşvik eden mekanizmalar belirlenmiştir. Siderofor, proteaz, hidrojen siyanür (HCN), amonyak (NH3) üretimi bu izolatlar tarafından gösterilen ana "antagonistik" mekanizmalar olarak belirlenmiştir. Bacillus subtilis izolatları fungal etmen S. sclerotiorum'un, Pseudomonas choloraphis, Bacillus subtilis, Acinetobacter tandoii ve Bacillus mojavensis izolatları ise B. cinereae'nin engelleme bölgesine yakın miseller üzerinde önemli düzeylerde morfolojik değişikliklere (pıhtılaşma, kararma ve erime gibi) neden olmuştur. Aynı zamanda, indol asetik asit (IAA) üretimi ve fosfor'u çözme etkinliği bakteriyel izolatların "bitki büyümesini teşvik eden" mekanizmaları olarak belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar, etkili antagonist bakteri izolatlarının kök ve yumrusu tüketilen bitkilerin fungal patojenlerine karşı gerek biyo-kontrol ajanları gerekse biyogübre olarak mükemmel bir uygulama potansiyeline sahip olduğunu göstermektedir. Bakteriyel türlerde antagonsitik etkinlik ve etki şekli farklılıkları tespit edildiğinden, bu izolatların fungal hastalıklara karşı karışım olarak kullanımı kimyasal mücadeleye alternatif olarak ümit verici olabilir