Asi nehrinden Escherıchıa colı izolasyonu, filogenetik grupları ve virülans özellikleri
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2024
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: FATMA DEMİRTAŞ
Danışman: EBRU ŞEBNEM YILMAZ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:İnsan kaynaklı her türlü kirleticinin nehirlere girişi, suyun fiziksel, kimyasal ve biyolojik bozulmasına yol açar. Bu çalışma başta tarımsal sulama ve çeşitli amaçlarla kullanılan Amik ovasını besleyen Asi Nehri boyunca belirlenen üç ayrı istasyonda on iki aylık örnekleme yapılarak gerçekleştirilmiştir. Bu amaçla, otuzaltı yüzey suyu örneğinin bazı su kalite parametre ölçümleri ile toplam koliform, E. coli sayımları gerçekleştirilerek, 34 (%94,4) E. coli izole edilmiştir. İzolatların 16 farklı antibiyotiğe olan duyarlılıkları, geniş spektrumlu beta laktamaz/plazmid aracılı AmpC beta laktamaz üretimleri, filogenetik grupları ve virülans özellikleri araştırıldı. Ölçümü gerçekleştirilen her su kalite parametresinin kendi içinde değişken değerler gösterdiği belirlendi. Toplam koliform ve E. coli sayım sonuçları değerlendirildiğinde en az kontaminasyonun Eşrefiye istasyonu, en çok kontamine istasyonun ise Küçük Asi istasyonu olduğu gözlemlendi. Fenotipik olarak 15 izolat (%44,11) geniş spektrum beta-laktamaz (GSBL) ve 5 izolat ise (%14,7) plazmid aracılı AmpC (pAmpC) beta-laktamaz üretimi yönünden pozitif değerlendirildi. İzolatlarda en yaygın GSBL tipi CTX-M (n:9) ve TEM (n:3) olarak bulunurken, pAmpC tip beta laktamaz üretici izolatların 6'sında CMY-2 tip beta-laktamaz enzimi belirlendi. Oniki (%35,29) E. coli izolatı test edilen antibiyotiklerin tamamına duyarlı bulunurken, diğer izolatların tamamı (imipenem hariç) antibiyotiklere değişen oranlarda direnç gösterdi. İzolatların PZR ile filogenetik grup dağılımları; A1 (n:15), B1 (n:6), B22 (n:5), B23 (n:4) ve A0 (n:4) olarak belirlendi. E. coli izolatlarının %58,8'inde (n: 20) en az bir veya daha fazla virülans geni tespit edilirken, 14 izolatta (%41,2) hiçbir virülans geni belirlenmedi. En yaygın virülans geni olarak papC (n:14, %41,2) ve iucD (n:11, % 32,3) tespit edildi. Tez bulguları, Asi Nehrinde mikrobiyolojik kaynaklı ciddi bir su kirliliğinin varlığını göstermiştir. Sonuçlarımız, su kaynaklarının sürdürülebilirliğini sağlamak ve halk sağlığını korumak için su kalitesi yönetiminde daha etkin stratejilerin benimsenmesi gerektiğinin önemini vurgulamaktadır.