Morfolino grubu taşıyan bileşiklerin alfa-amilaz, alfa-glukozidaz ve üreaz enzimleriyle etkileşiminin moleküler doking, MM/GBSA ve moleküler dinamik çalışması

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FİZİK (YL) (OSMANİYE KORKUT ATA ÜNİV. ORTAK), Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2024

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: GÜLGÜN MANSUROĞLU

Danışman: Berna Çatıkkaş

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bu tez çalışmasında diyabet, ülser, gastrit hastalığını değerlendirmek için alfa-amilaz, alfa-glukozidaz ve üreaz enzimleri için Veri Bankasından (PDB numarası): 5E0F, 5NN5 ve 7ZCY hedef olarak seçilmiştir. Bu çalışmada ilaç adayı olarak, morfolino grubuna sahip, asetamit türevi 9 bileşik kullanılmıştır. Bileşiklerin önce konformasyon analizi yapıldıktan sonra optimize yapıları belirlenmiştir. Hedef enzimlerle ilaç adayı bileşiklerin ve referans bileşiklerin etkileşmeleri moleküler doking ve moleküler mekanik/genelleştirilmiş Born yüzey alanı (MM/GBSA) yöntemleri ile bağlanma enerjileri hesaplanmış ve analiz edilmiştir. MM/GBSA hesabı sonuçlarına göre en iyi sonuç veren bileşikler ve referans maddelerin hedef enzimlerle etkileşmeleri 100 ns moleküler dinamik simülasyonu ile incelenmiştir. Bileşiklerin ilaç özelliklerine sahip oldukları, absorpsiyon, dağılım, metabolizma, eliminasyon (ADME) hesaplamaları ile elde edilmiştir.