Çiğ sütlerden enterococcus spp. izolasyonu, antibiyotik dirençlilik ve bazı virulans faktörlerin belirlenmesi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOLOJİ ANABİLİM DALI, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: DENİZ MÜRŞİTOĞLU
Danışman: EBRU ŞEBNEM YILMAZ
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:ÖZET ÇİĞ SÜTLERDEN ENTEROCOCCUS SPP. İZOLASYONU, ANTİBİYOTİK DİRENÇLİLİK VE BAZI VİRULANS FAKTÖRLERİNİN BELİRLENMESİ Bu çalışmada Hatay ilinde satışa sunulan çiğ sütlerde enterokok türlerinin izolasyonu ve identifikasyonu, izolatların antibiyotiklere olan duyarlılıklarının, dirence aracılık eden mekanizmaların ve virülens genlerinin (asa1, gelE, cylA, esp ve hyl) belirlenmesi amaçlandı. Bu kapsamda incelenen 120 çiğ süt örneğinin 95'inden (%79.2) Enterococcus spp. izole edildi. Tür spesifik primerlerle yapılan Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile izolatların 87'si (%91.6) E. faecalis, 5'i (%5.3) E. faecium, 2'si (%2.1) E. durans ve 1'i de (%1.1) E. gallinarium olarak identifiye edildi. İzolatların tamamı vankomisine duyarlı bulunurken, %41,1'i (n=39) tetrasikline, %33,7'si (n=32) rifampine, %27,4'ü ampisiline (n=26), %11,6'sı eritromisine (n=11), %5,3'ü yüksek düzeyde gentamisine (n=5), %3,2'si kloramfenikole (n=3) ve %2,1'i (n=2) de siproflaksasine dirençli bulundu. İzolatların 29'u (%30,5) ise incelenen tüm antibiyotiklere duyarlı bulundu. mPZR ile araştırılan virülens genleri izolatların 84'ünde (%88,4) saptandı. En yaygın virülens geni olarak gelE (67, %79,8) saptanırken; bunu sırasıyla asa1 (54, %64,3), esp (53, %63,1) ve cylA geni (9, %10,7) izledi. İzolatların hiçbirinde ise hyl geni tespit edilmedi. Tetrasiklin dirençli izolatların 32'inde tetM, 2'sinde tetK, 2'sinde tetL ve 4'ünde tetM ve tetK birlikte tespit edildi. Eritromisin direnç genlerinden ermB 8 izolatta ve ermA 1 izolatta, cat geni ise kloramfenikol dirençli izolatların sadece 1'inde tespit edildi. Aminoglikozid dirençli izolatların 3'ünde aac(6)-Ie-aph(2)-Ia geni, 1'inde ise aac(6')-Ie-aph(2'')-Ia + aph(3)-IIIa geni birlikte belirlendi. Çalışmanın sonuçları çiğ sütlerin antibiyotik direnç ve virülens genleri yönünden önemli bir rezervuar olduğunu göstermiştir. Çiğ sütlerin tüketilmesi sonucunda gastrointestinal sistemde bulunan diğer bakterilere bu genlerin aktarılması halk sağlığı açısından potansiyel öneme sahiptir. Bu nedenle çiğ sütlerdeki bakterilerin antibiyotik direnç profillerinin ve virülens özelliklerinin sürekli izlenmesi önem arz etmektedir.